造成公藏獒不育的原因也很多，但绝大部分是后天性的。通过加强营养、调整体况适量运动乃至药物调整可逐渐恢复。
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（一）营养不良
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公犬长期营养不良，或营养不平衡，饲料蛋白质品质较差，蛋白质的生物学价值低，缺乏维生素E 、维生素A 或维生素D ，缺乏矿物质元素钙、磷、铜、硒、锌、铁、钠盐等，钙、磷比例失调，诸多的原因都可能造成公犬精液品质差，精子数量少、活力差，畸形精子多，精液量减少，进而严重影响配种效果。
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（二）环境性不育
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大龄公藏獒对环境的改变，包括迁离居住地，更换新主人，改变饲养管理方式，以及交配时有陌生人在场等都会影响公犬的情绪。公犬因思念旧居住地，怀念老主人，加之身体尚未适应，性欲发生反射性抑制，对母犬不感兴趣。如果用药物催情，就会严重伤害公犬的性机能，出现精液稀薄，精子无活力或出现畸形，造成不育。
（三）疾病性不育
某些传染病、寄生虫病、内科病、外科病、生殖器官的疾病都会引起公犬不育。例如，睾丸发育不全、隐梁、睾丸萎缩、睾丸炎、副性腺炎症、包茎、阳痿等，都会使公藏獒缺乏性欲拒绝交配，或对母犬不感兴趣，不愿交配，或者精液品质不良，造成不育。
引起公犬不育的原因是极其复杂的。为了防止不育，首先必须弄清不育的原因，对公犬生殖系统各个器官进行认真的检查和诊断，必要时可采取理疗调理、中药治理、抗生素消除炎症以及加强活动锻炼等各种综合措施。注意改善和加强饲养管理，调整犬只的营养水平和体况，保持足够的运动或散放自由活动，使犬只各组织器官的结构与功能达到有机的协调和统一，进而使公藏獒的生殖系统能发挥其正常生理活动，发挥其配种能力。
三、公藏獒的繁殖学检查
在开展藏獒品种资源保护，加强对藏獒选种选配中，首先要对种公犬的配种能力或繁殖力做出评价，特别是在需要引进种公犬时，对预购公犬进行全面的繁殖学检查是必不可少的程序之一。
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（一）公犬的病史
查阅公藏獒的病史资料是为了了解该公犬以往的患病情况，特别是有关繁殖疾病的发生和治疗情况、状态及水平。种公犬的病史资料应包括有关公犬的年龄、体重、体质类型、生长发育状况、饲养管理条件、预防接种的疫苗种类和时间、预防接种的效果、曾患疾病的种类与治疗情况等一般性的常规资料。但更重要的是必须记录公犬历年的配种资料，包括与配母犬的受胎率、产仔率和断奶成活率；公犬的繁殖疾病、治疗方案及治疗效果。如果被检查公犬确实存在久配不孕或虽可怀孕，但窝产仔数少，则应同时了解该母犬的繁殖历史和饲养管理情况，以便对公犬的繁殖能力做出较科学的评价和诊断。
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