一、严格选择种蛋
种蛋必须来自优良、健康的鸟群，挑选种蛋时，先将薄壳蛋、砂壳蛋、钢皮蛋及过大、过小、过扁、过圆、污染面积过大的种蛋挑出。对刚产出的种蛋不宜马上入孵，要蹙贮存小时以上，但最好不要超过天，保存的温度以℃为宜。若保存期超过天，需要降低温度，保存种蛋的相对适宜湿度应为70%～80%，并注意贮存室的通风。种蛋保存时，应大头朝下，每天翻动次。
二、完善卫生消毒措施
．鸵鸟蛋贮藏室的消毒。每天用消毒液擦地板次，隔周全部清洗、消毒，并用福尔马林溶液进行熏蒸。
．种蛋的消毒。鸵鸟产蛋时，饲养员要用消毒纱布接住，然后送孵化室消毒，消毒剂量每平方米用7%的福尔马林毫升，高锰酸钾克，熏蒸0分钟。如果没有接住，用经消毒液浸泡的纱布擦去表面赃物，马上送孵化室消毒。入孵之前，用消毒药（温度不要超过0℃）浸泡0～0秒，然后用消毒过的干纱布擦干种蛋即可入孵。
．孵化室的消毒。孵化室地板每隔天用消毒药拖擦次，墙壁、天花板每隔半个月用消毒药喷洒次，个月进行全面清扫次。
．孵化机的消毒。每次孵化之前，孵化机内外及表面用消毒药擦拭一遍，并用福尔马林熏蒸消毒。
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三、适宜的孵化条件
．适宜的温度。经验发现，室温在8℃～℃时，如果采用恒温孵化法孵化温度控制在7℃效果最好，随着室温的升高，孵化温度可适当降低。也可采用变温孵化法，将孵化期分为前期、中期和后期，温度可分别控制为.℃、℃、.℃，其相应相对温度分别为%、%、%，并且种蛋可按大、中、小或重、中、轻个档次，实行分机孵化，能提高孵化率和健雏率。
．适合的温度。对于恒温孵化法，前期孵化温度可控制在0%～%，转入出雏机湿度应相对提高，通常为0%～0%，后期湿度相对较高有利于雏鸡啄壳。
．合理通风与凉蛋。胚胎发育需要新鲜的空气和充足的氧气，二氧化碳和各种有害气体不要超标，因此，应定期通风换气。鸵鸟蛋的体积较大，蛋壳较厚，尤其后期产热较多，应主要凉蛋。
．正确的腐化操作过程。入孵时，一定要使鸵鸟蛋的大头朝上，依贮存期、产蛋期分清批次，认真记录，尽量不要混孵，以免造成出雏的混乱，孵化过程中要翻蛋，孵化程序为：蛋的挑选→消毒→贮存室→孵化室→入孵→消毒→出鸟→发鸟作业，避免交叉感染。
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